百迈客农学—结题报告讲解

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全转

SRNA保留read长度15-35nt

环状RNA使用BWA软件与参考基因组比对,与其他产品不一致

circle定量 SRPBM

 

SRNA比对 bowtie

SRNA靶基因预测软件 植物TargetFinder  动物用miRanda和targetscan交集

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样品表达量总体分布图

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碱基错误率

lncRNA 和sRNA文库

唯一比对到参考基因组,之比对到一个位置

比对分布情况,上面是正链上的深度,中间比对补上

是着丝粒的存在  

文库评估::reads百分比 匹配到一个基因

reads百分比 基因比例 纵坐标

大部分样品有相似的表达模式。

biaodaliangxiangguangxing表达量相关性

cosmic 癌基因集相关注释数据库

 

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全转录组数据分析包括Ink RNA、mRNA、mic RNA、c RNA

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分析4种RNA linkRNA mRNA circRNA miRNA 


 

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