微生物系列课程

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RDA/CCA分析,夹角角度“锐角正相关,钝角负相关;点点距离:距离越近,相似性越大

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1. PCA:多维数据转为二维坐标,去冗余和降噪

2. PCoA: 

3. NMDS:点之间距离表示差异大小,stress值反映分析可靠性,<0.01分析结果极为可靠的;

4. UPGMA:枝长越短,差异越小;

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Beta多样性分析

主成分分析:

共线率越高,越能反应原始信息,图中不同颜色反应不同样品

 

 

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7.19 第2课 Beta多样性分析

 

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