微生物系列课程

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操作步骤:

一、样品间分析:同下(组间分析会将不同样品标记不同的颜色,这个不会)

 

二、组间分析:选择样品---分类水平选择(OTU或其他)---提交

表格:样品坐标表(展示了每一个样品在第一轴、第二轴、第三轴的具体的坐标信息)

各坐标解释度表(反映了第一轴、第二轴、第三轴的贡献率)

图片:从三个层次反映PCA分析的结果(第一轴和第二轴;第一轴和第三轴;第二轴和第三轴)

点表示了不同的样品,点的颜色代表了分组信息;可以点击修改图片,选择是否选择样品名称,选择加圈(置信椭圆,有五个样品才可做这个),是否进行组间差异检验(任意选择一种),主标题(PCA),X轴标题(PC1),Y轴标题(PC2),点击确定

 

同一组样品添加了置信椭圆

 

最后的分析结果可以保存和下载

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张雪琳 · 2020-08-18 · PCA分析 0

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