中间的10244,核心基因所在的共有家族,还有分化出的单拷贝直系同源基因家族 ,利用分化出的单拷贝直系同源基因做出系统进化树,这是一种通过单拷贝直系同源基因,进行共线性比对,做基因家族聚类做出的系统进化树
扩张,就是最后的拷贝出的基因家族的增加或减少,+代表扩张,-代表减少。
碱基的变化导致编码的氨基酸变化/没变化,即为非同义替换/同义替换
基因组水平共线性--后种方法
基因水平共线性---选前种方法