GWAS培训课程

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GWAS H0(原假设): y=u+e

H1: y=u+Xb +e 

若 H0成立概率很低,则拒绝原假设,即SNP与表型相关

两类错误:

I类错误:假阳性,拒绝真实的H0, a

II类错误:假阴性,接受错误的H0;b

power(功效):拒绝错误H0的概率:1-b

固定效应:群体效应,

随意效应:interest on populaton behind the levels 

 

 

EMMA: two dimensions to one dimension optimization/多微效基因

MLMM: 低效应位点效率很高/将大效应位点作为背景再次进行检测

FARM-CPU/  

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