全转
SRNA保留read长度15-35nt
环状RNA使用BWA软件与参考基因组比对,与其他产品不一致
circle定量 SRPBM
SRNA比对 bowtie
SRNA靶基因预测软件 植物TargetFinder 动物用miRanda和targetscan交集
全转
SRNA保留read长度15-35nt
环状RNA使用BWA软件与参考基因组比对,与其他产品不一致
circle定量 SRPBM
SRNA比对 bowtie
SRNA靶基因预测软件 植物TargetFinder 动物用miRanda和targetscan交集
样品表达量总体分布图
碱基错误率
lncRNA 和sRNA文库
唯一比对到参考基因组,之比对到一个位置
比对分布情况,上面是正链上的深度,中间比对补上
是着丝粒的存在
文库评估::reads百分比 匹配到一个基因
reads百分比 基因比例 纵坐标
大部分样品有相似的表达模式。
biaodaliangxiangguangxing表达量相关性
cosmic 癌基因集相关注释数据库
全转录组数据分析包括Ink RNA、mRNA、mic RNA、c RNA
分析4种RNA linkRNA mRNA circRNA miRNA