遗传图谱生物信息培训班

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价格 ¥500.00
教学计划
课程介绍

本课程包括两部分,第一部分从测序技术出发,讲解重测序技术与SLAF技术的基本原理,并介绍了比对,以及变异检测的方法,还会演示BWA,GATK的使用方法及重要文件格式的解读。

具体分为四个系列课程:

1. 重测序与SLAF简化技术介绍。内容包括全基因组重测序技术原理,Hiseq测序技术流程,重测序应用范围,SLAF技术原理,技术流程,技术特点,技术应用领域等。

2. 比对_SNP calling与SLAF标记开发。内容包括序列比对,变异检测和SLAF标记开发的原理,方法等。

3. SAM文件与序列比对软件实操_合并。内容包括全局比对,局部比对,短序列比对的原理,应用场景及操作命令等,短序列比对结果文件的解读,实操演示。

4. VCF文件与SNP calling软件实操_合并。内容包括SNP calling流程讲解,VCF文件格式与具体内容讲解,GATK软件流程讲解及实操演示。

第二部分介绍了遗传图谱的构建原理,并详细介绍了遗传图谱的构建步骤。同时,本课程优选了几款常用的构图以及QTL定位软件:JOINMAP,QTLmap,winQTLcart软件,详细介绍了软件的使用方法及其输入输出格式。

具体分为六个系列课程:

1. 遗传图谱与连锁简介。内容包括遗传图谱的概念和应用,常见分子标记类型,重组率的计算,遗传图谱的基本特性。

2. 群体类型构建与样本选择。内容包括遗传群体类型讲解,样本选择的原则。

3. 图谱构建步骤与原理。内容包括构建遗传图谱的生物信息学步骤,Highmap简介。

4. 遗传图谱构建软件Joinmap实操。内容包括Joinmap的实操演示。

5. QTL定位软件mapQTL实操。内容包括mapQTL的实操演示。

6. QTL定位软件winQTLcart实操。内容包括winQTLcart的实操演示