冗余的reads删去

SNP检测：非同义突变的（编码区）进行注释

InDel检测： 编码区小片段的插入和缺失的基因进行注释

SV：大片段的结构变异插入、缺失、倒位的结构变异的基因进行注释。

测序数据质控：Fstaq格式存储

若下机的数据是64位的，则需要将64位的数据转化为33位的。

对第四行的数据进行统计（测序质量），每一种符号对应的质量信息。

Clean_Base表明自己的数据量；Q30：1000个碱基只有一个可能存在错误；是否达到了合同的要求 （越高越好），样品好，测序质量高；GC%含量可以看一下样本之间有没有差异；

Q40表示10000碱基只有一个碱基可能发生错误。

对测序的reads进行ACGT是否发生了分离：双端测序数据具有两条reads，纵坐标值越小越好；