一、GWAS模型
1、速度快的:GenABEL、GEMMA、MLM、EMMA、P3D/EMMAX(介绍)、FaST-LMM(介绍)
2、能力最强:CMLM、ECMLM、Select、SUPER、MLMM
3、最新的软件:blink、FarmCPU
二、选择考虑因素
质量形状还是数量形状(不同的检验方式)
三、主要数学模型
y=SNP+Q+Kinship+e
(Q是群体结构效应)