GWAS H0(原假设): y=u+e
H1: y=u+Xb +e
若 H0成立概率很低,则拒绝原假设,即SNP与表型相关
两类错误:
I类错误:假阳性,拒绝真实的H0, a
II类错误:假阴性,接受错误的H0;b
power(功效):拒绝错误H0的概率:1-b
固定效应:群体效应,
随意效应:interest on populaton behind the levels
EMMA: two dimensions to one dimension optimization/多微效基因
MLMM: 低效应位点效率很高/将大效应位点作为背景再次进行检测
FARM-CPU/